Натамицин является антибиотиком противогрибкового и фунгицидного действия. Лечебный эффект обусловлен связыванием препарата со стеролами клеточных мембран возбудителя, в следствие чего нарушается их проницаемость и целостность, а в дальнейшем приводящим к гибели гриба.
Эффективен по отношению к большинству дрожжеподобных грибковых инфекций (в частности, к Candida albicans), бластомицетов (Trichophyton, Microsporum, Epidermophyton), дрожжей (Torulopsis и Rhodotorula), других грибковых заболеваний, а также по отношению к некоторым простейшим (трихомонадам). Не эффективен к грамположительным и грамотрицательным микроорганизмам.
Препарат натамицин плохо всасывается из желудочно-кишечного тракта, благодаря кишечно-растворимому покрытию, позволяющее действовать непосредственно в кишечнике, через неповрежденный кожный покров и слизистые оболочки. При применении вагинальных свечей, благодаря действию температуры тела появляется пенистая масса, способствующая равномерному распределению препарата по всей слизистой оболочке.
Препарат эффективен при применении в офтальмологии для лечения таких заболеваний как: блефарит, конъюнктивит, кератит, и других нерезистентных к натамицину грибковых заболеваниях.